Team:Goettingen/Project deu

Unser Projekt

Unser Projekt wurde aus der Idee geboren einen echten Champion zu kreieren: Den schnellsten E. coli der Welt. Auch wenn dies zunächst absurd klingt, haben wir uns bald an die Erstellung eines ambitionierten Plans gemacht um unseren „Homing (zielsuchenden) Coli“ zu entwickeln und uns seine Schnelligkeit für Selektionssysteme zunutze zu machen. Das letztendliche Ziel sollte ein schnell schwimmender E. coli-Stamm sein, der spezifische Moleküle über einen mutagenisierten Rezeptor erkennen und sich entlang eines Gradienten solcher Substanzen bewegen kann. Falls dieser Ansatz Erfolg haben sollte, könnte er zur Erkennung von Schadstoffen, Toxinen oder sogar Krebszellmarkern weiterentwickelt werden. Während unsere Planung voranschritt haben wir die Arbeit in drei große Bereiche aufgegliedert um gleichzeitig an den wichtigsten Teilen unseres Projektes arbeiten zu können.

Die erste Gruppe richtet ihren Fokus auf die Erstellung von effektiven Schwimmverhalten-Tests. Viele unterschiedliche Medien und Schwimm-Agarplatten wurden erstellt und getestet, denn nur bei guten Bedingungen können E. coli ihre Schnelligkeit auch unter Beweis stellen. Desweiteren sollte auch ein effektives Selektionssystem kreiert werden, um die schnellen von den langsamen Bakterien zu trennen und später zu bestimmen, ob diese bestimmte Substanzen erkennen können. Die Erstellung eines schnellen E. coli-Stamms stellt die Hauptaufgabe der zweiten Gruppe dar. Die Hauptfrage ist: welche Gene haben einen Einfluss auf die Schnelligkeit und wie müssen diese reguliert werden um den gewünschten Effekt zu erzielen? Natürlich wurden unter anderem Gene die für Teile des bakteriellen Motors, dem Flagellum, kodieren ausgewählt und auch FlhDC, einen Hauptregulator für Motilität und Chemotaxis. Das Ergebnis dieser Arbeit kann dann auf den Schwimmagarplatten visualisiert werden.

Die dritte Gruppe befasst sich mit der gerichteten Mutagenese des Aspartat-Rezeptors TAR. Dadurch kann eine Bibliothek von zahlreichen neuen und verschiedenen TAR-Rezeptoren erstellt werden. Manche von diesen könnten in der Lage sein bestimmte Moleküle zu binden und so zu erkennen. Mit solchen Rezeptoren ausgestattet, können die E. coli darauf untersucht werden, ob sie sich auf eine Auswahl von bestimmten chemischen Substanzen zubewegen.

Diese drei Gruppen sollten sich in den frühen Phasen der Laborarbeit an ihren speziellen Projekten orientieren und zumindest die Laborarbeit somit auch separat planen. Mit der Zeit werden aber alle Fortschritte und Ergebnisse die Kooperation der Teilprojekte ermöglichen um dann unser Ziel zu erreichen: Homing Coli.

Chemotaxis

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