Team:Goettingen/News deu

25. September 2012, BioBricks sind auf dem Weg!
It is done. The BioBricks are sent to America´s iGEM head quarter! Say good-bye to good old Germany. Wish you the best. Have fun with you new users :D.

13. September 2012, 13 Tage noch
As the deadline is coming closer we now have to start to produce the figures necessary for our results part. We decided to meet twice during each week to be able to discuss everything fast and effective. In order to not reduce your anticipation (and because it will not be very interesting) we will not summarize the following meetings but of cause we will keep you updated as soon we have interesting news!

07. September 2012, Unser Informationsabend "Legoland für Naturwissenschaftler" findet heute im ZHG der Universität Göttingen statt.
Alle Informationen finden Sie hier.

06. September 2012, Nur noch ein Tag bis zum Informationsabend "Legoland für Naturwissenschaftler"!
Im heutigen Meeting haben wir über das Thema des Informationsabends geredet. Wir haben weiterhin über die Präsentation von iGEM, unserem Projekt und über die Einleitungen der Redner dikutiert. Danach haben wir die Diskussion simuliert. Jeder von uns ist sehr nervös, aber wir freuen uns natürlich alle schon sehr auf den Informationsabend.

30. August 2012, Die erste Version von "Flash Coli - das Spiel" ist nun online!
Flash coli benötigt IHRE Hilfe die schrecklichen Phagen zu bekämpfen. Klicken Sie hier, um zu spielen.

25. August 2012, Heute ist der "Synthetische Biologie"-Tag in Deutschland.
Was ist los? Lesen Sie mehr hier.

15. August 2012, In unserem wöchentlichen Seminar hat uns Anna heute ein Beispiel aus einem Journal zur Synthetischen Biologie vorgestellt.

08. August 2012, Umfrage: Bereit befragt zu werden?
Heute haben wir weiter an unserer Umfrage gearbeitet und so wie es aussieht, werden wir bald fertig sein. Auch unsere Homepage nimmt langsam Gestalt an. Die Homepage soll in der finalen Version sowohl auf Englisch als auch auf Deutsch zu lesen sein, um unseren interessierten Mitbürgern die Möglichkeit zu bieten, sich über unser Projekt zu informieren. Da unsere Stämme immer noch nicht „schwimmen“, haben wir geplant an Prof. Parkinson zu schreiben, da er die MG Stämme konstruiert hat und erhoffen uns dadurch Ratschläge für unsere Experimente zu bekommen. Weiterhin arbeiten Gruppe eins und zwei immer noch zusammen an den „swarming “ Platten der neuen Konstrukte. Bei Gruppe 3 Probleme treten Probleme in der Konstruktion der Mutations Bibliothek auf.

01. August 2012, Ali und Sandra haben Vorträge im Rahmen unseres wöchentlichen Meetings gehalten.
Heute haben wir uns zum ersten Mal vor unserem eigentlichem „Meeting“ getroffen, und konnten somit über mehr Themen diskutieren. Darunter waren Themen wie „Human Practice“ oder die Teilnahme eines Studenten von einem unterem Semester, der an unserer Arbeit interessiert ist. Des Weiteren haben sich Anna, Bianca und Simon getroffen, um unser Team für den „Preis des Stiftungsrates“ der Universität vorzuschlagen.
Da sich unsere Stämme nach drei Tagen Inkubation nur langsam bewegen, haben wir die Stämme RP 437 und MG von Arbeitsgruppen mit Erfahrung bezüglich dieser Stämme angefordert. Somit können wir anfangen die neuen Stämme zu testen. Zusätzlich haben wir über mögliche Ziele unsere mutierten Tar-Konstrukte diskutiert. Nach unserem offiziellen „Meeting“ haben wir uns Präsentationen von zwei Team-Mitgliedern angehört. Alicia’s paper hatte den Titel “Engineering microbes to sense and eradicate Pseudomonas aeruginosa , a human pathogen" (Saeidi N., et al. , 2011)” und präsentierte ein Beispiel der Synthetische Biologie für ein System um Biofilmformation in P. aeruginosa, zu inhibieren. Saeidi et al. entwickelte ein E. coli Bakterium um Bacteriocin zu produzieren. Dieses ist ein antimikrobielles und lysierendes Enzym, welches die E. coli Zellwand zerstört durch das „Quorum sensing“ Molekül AHL produziert von P. aeruginos. Sie konnten zeigen, dass man durch dieses Systeme eine Vernichtung von P. aeruginosa in vitro möglich machen kann. Danke an Alicia für ihren inspirierenden Vortrag! Der zweite Vortrag wurde von Sandra gehalten. Sie präsentierte das Thema "Synthetic Biology: Integrated Gene Circuits"(Nagarajan Nandagopal and Michael B. Elowitz, 2012). Normalerweise aktiviert Signal eine Signalkaskade. In der synthetischen Biologie ist es theoretisch möglich einen Signalweg mit beliebigen “outputs” zu kreieren. Des Weiteren hat sie uns über den Mechanismus der „Chemotaxis“ informiert. Vielen Dank Sandra für deinen interessanten Vortrag!

19. August 2012, "Human practice task force" gegründet!
Da unser „Human Practice“ viel Zeit in Anspruch nimmt und uns die Zeit im „Meeting“ fehlt, haben wir uns entschlossen ein „human practice task force“ Team zu gründen. Das Team wird sich in Zukunft zu einer anderen Zeit treffen. Zusätzlich zu unserem „Meeting“ am Mittwoch werden wir uns schon vorher treffen um anstehende Arbeiten, wie zum Beispiel für das Gestalten der Homepage zu besprechen und auszuarbeiten. Des Weiteren wachsen die Stämme nur nach drei Tagen Inkubationszeit und Gruppe eins hat beschlossen nach Stämmen anderer Arbeitsgruppen zu fragen.

12. Juli 2012, Heute hat Christian in unserem wöchentlichen Meeting etwas über den europäischen "Teacher meet-up" in Paris erzählt.
In unserem heutigen „Meeting“ hatten wir den PhD Studenten Christian aus der Arbeitsgruppe von Heinz und den Studenten Miguel aus derselben Gruppe zu Gast. Miguel hatte bereits im vorigen Jahr an iGEM teilgenommen und gewann mit seinem Team eine Silbermedaille. Christian hatte für uns an dem „teacher meet up“ in Paris teilgenommen und hat uns nun seine Erfahrungen berichtet. Besonders viele hilfreiche Tipps konnte er uns zu den Themen „Human Practise“. Dafür bedanken wir uns recht herzlich bei Christian! Bezüglich des Themas „Human Practise“ haben wir uns auf einen auf einen Umfrage im Rahmen der synthetischen Biologie in der Göttinger Innenstadt geeinigt. Darauf aufbauen soll eine Podiumsdiskussion in der die Umfrageergebnisse vorstellt und diskutiert werden sollen. Gruppe eins konnte den schnellsten Stamm bestimmen, jedoch nur nach drei Tagen Inkubationszeit. Unterschiede zwischen den verschiedenen Promoterstärken konnte nicht nachgewiesen werden. Es konnte jedoch für das Tar Insert eine Bewegung in Richtung Trypton für die verschiedenen Promotoren gesehen werden. Gruppe zwei hat 5 verschiedene Gene isoliert und kloniert diese in die BioBrick Vektoren. Gruppe drei hat den ersten Durchgang für die Mutation Bibliothek beendet, jedoch war der Ertrag der Kolonien sehr gering und eine Wiederholung des Durchganges ist geplant.

04. Juli 2012, Es werde Licht!
Wir haben endlich ein Lichtmikroskop in unserem Labor! Nun können wir sehen, ob die Stämme überhaupt laufen. Gruppe 1 untersucht derweil die gerichtete Bewegung in anderen Stämmen und versucht jetzt herauszufinden welcher Promoter am besten geeignet ist. Gruppe 2 startet mit der Selektion anderer Proteine, deren Überexpression die „schwimm“ Eigenschaften der Stämme verbessern könnten. Dieser wurden dann in Vektoren kloniert. Gruppe 3 arbeitet immer noch an der Mutation des Tar Rezeptors. Jan hatte eine gute Idee für „Human Practice“. Seine Idee war es einen Postcast über synthetische Biologie aufzunehmen.

28. Juni 2012, Anna, Corinna and Erik haben am dritten, jährlichen Kongress für geplante Prozesse "Biotechnology 2020+" in Berlin teilgenommen.
Wie war es? Lesen Sie mehr hier.

26. Juni 2012, E. coli Stamm beflügelt!
Gruppe 1 findet endlich einen Stamm, der gerichtete Bewegung zeigt!

21. Juni 2012, Unser erstes Posterdesign ist fertig.
Heute haben wir wieder einmal über Human Practice gesprochen. Es wurde die Idee geäußert einen Tag der offenen Tür für Studenten der unteren Semester zu veranstalten. Wir haben uns dafür entschlossen Ideen von Teams aus vergangener Zeit zu nehmen und diese dann „nachzukochen“. Allerdings hat sich herausgestellt, dass eine Umfrage mit anschließender Podiumsdiskussion am besten zu organisieren ist, da momentan Semesterferien sowie Schulferien sind. Gruppe 1 hat beschlossen einen neuen Minimal Agar zu für die Schwimmversuche zu testen und Gruppe 2 ist gerade dabei RT-PCR zu planen, um die Expression der mRNA der verschiedenen Promotoren in FlhDC zu testen. Gruppe 3 hat derweil eine Unterbesetzung, da Alicia und Anna ein Praktikum haben. Glücklicherweise haben Gruppe 1 und 2 angeboten zu helfen. Gruppe 3 wird bald mit der mutations Bibliothek des Tar Rezeptors starten.

13. Juni 2012, Herausforderung: Finde ein Human practice-Project!
In dem heutigen Meeting, haben wir hauptsächlich über weitere Ideen für Human Practice diskutiert, die viel Organisation erfordern. Des Weiteren haben wir Dr. Hoppert darum gebeten uns bei den Eletronenmikroskop-aufnahmen zu unterstützen. Da wir uns auch dafür entschieden haben ein Poster an dem Kongress für Strategie Prozesse „Biotechnology 2020+", zu präsentieren, haben wir uns über das Design Gedanken gemacht. Gruppe 1 hat immer noch Probleme mit dem Agar aber die Chemotaxis Versuche werden nächste Woche angefangen. Gruppe 2 hat erfolgreich FlhDC hinter die verschiedenen Promotoren kloniert und Gruppe 3 konnte dasselbe für den Tar Rezeptor vorweisen.

06. Juni 2012, Thomas Maschner, iGEM-Teamleiter der LMU München, hat uns besucht.
Heute konnte Heinz uns berichten, dass er einen Computer für unser Labor organisieren konnte, welches die Laborarbeit um einiges erleichtern wird. Weiterhin haben wir ein Treffen mit Thorsten Maschner von der LMU München für morgen vereinbaren können. Wir haben das GL2 gefragt, ob sie uns bei unser Projekt mit Sequenzierungen unterstützen können. Danach hat jede Gruppe neue Ergebnisse und Fortschritte vorgetragen. Gruppe 1 hat Probleme mit ihren „Schwimmversuchen“. Wir haben daraufhin entschieden andere Konditionen zu testen, wie zum Beispiel das Animpfen mit verschiedenen Volumen der Zellkulturen und niedrigeren Nähstoffen im Medium. Gruppe 2 hat unsere Konstrukten in verschiedene Vektoren kloniert und plant diese dann zu sequenzieren. Gruppe 3 konnte die erste QuickChange erfolgreich beenden.

01. Juni 2012, Diskussion der ersten Laborergebnisse.
Da wir an diesem Tag keine organisatorischen Sachen zu besprechen hatten, wurden nur die Gruppenergebnisse vorgetragen. Gruppe 1 wird damit anfangen „screening“ Tests der Transformanten von Gruppe 2 durchzuführen. Gruppe 2 wird weiterhin die verschiedenen Promoter Konstrukte in den Kombinationen testen. Gruppe 3 ist nun bereit für die QuickChange! Nach dem Meeting haben wir über das paper Looger et al., 2003, Nature diskutiert. In diesem paper haben sie eine Computer Methode vorgestellt, mit der es möglich ist Rezeptor-Liganden Bindungen als Strukturform darzustellen. Diese Software könnte für uns Vorteile bringen.

15. Mai 2012, Unser erstes Gruppenbild wurde gemacht!
Lernen Sie uns, unsere Betreuer und Unterstützer kennen! Klicken Sie dazu auf das Bild.

11. Mai 2012, Das iGEM Team Göttingen ist im Göttinger Tageblatt!
Wie dies? Lesen Sie mehr darüber hier.

04. Mai 2012, KWS SAAT AG ist nun Head Sponsor.

02. Mai 2012, Heute hat Anna unser neues iGEM Logo präsentiert.
Anna präsentierte ihre Designs für das Logo unseres iGEM Teams. Wir mochten diese sehr! Auf unserer Homepage können Sie nun das Design mit den meisten Stimmen bewundern.

30. April 2012, Wir haben heute zum ersten Mal das Labor am Max Planck Campus inspiziert.
Heute hatten wir die erste Labor Besichtigung mit Steffen Frey in dem sogenannten „Demolab“. Unser Labor hat nun den S1 Sicherheits Status. Wir sind dem MPI sehr dankbar für die Möglichkeit in dem Labor zu arbeiten und für die Unterstützung durch Materialien. Nach den Treffen haben wir über die Laborarbeit gesprochen. Da es leider dazu gekommen ist, dass wir vorerst keine Materialeien und Geräte von der Universität bekommen, konnte uns Heinz mit den Grundmaterialien behilflich sein. Somit konnten wir die ersten Schwimmversuche auf den Agarplatten starten.

26. April 2012, Wöchentliches Meeting: PCR-Präsentation von Heinz
In dem heutigen Meeting hat Simon uns berichtet, welches die iGEM Voraussetzungen sind. Zum Beispiel hat er über die BioBrick Bauteile gesprochen, die eingereicht werden müssen und über das iGEM „distribution Kit“, dass bald ankommen sollte. Frau Ludwig, die verantwortliche für die Laborausstattungen des Praktikums, hat uns unsere Geräte genehmigt. Somit haben wir über den Transport geredet. Des Weiteren hat Erik uns noch einen eine Liste über die möglichen Sponsoren vorgestellt. Heinz hat uns eine Einführung in die PRC Methode gegeben (z.B QuickChange PCR), sowie Primerdesign. Es war sehr interessant, dies von jemand zu hören, viel Laborerfahrung hat und wir uns die Verfahren nicht nur aus Literaturquellen erarbeiten müssen. Danach haben wir über mögliche Methoden für unser Projekt diskutiert.

19. April 2012, Das iGEM Team Göttingen 2012 ist nun komplett!
Heute war das erste Treffen des gesamten finalen iGEM Team Göttingens! Heinz stellte erneut das Thema allen neuen Mitgliedern vor und beschrieb kurz die Herausforderungen jeder der drei Gruppen, in die das Projekt eingeteilt wird. Dann präsentierte uns Erik unseren ersten Sponsor: die Firma Sartorius StedimBiotech! Wir sind alle sehr dankbar, dass sie unser Projekt mit 5000 € unterstützen! Danach diskutierten wir organisatorische Aufgaben wie das Laborbuch, Beschaffung von Geldmitteln, Wikieinträge und benötigte Software. Um die tatsächliche in unserem Labor am MPI starten zu können, wurde eine Liste für weiteres Equipemnt und Zubehör erstellt. Corinna und Berit werden das Universitätslager nach den zusätzlichen Material fragen.

04 April 2012, Sartorius Stedim Biotech GmbH ist nun Premium Sponsor.