Team:KIT-Kyoto/Notebook-week2p

From 2012.igem.org

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<br>
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                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week1p"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/1/1b/Side_week1kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
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                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week2p"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/9/94/Side_week2kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
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                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week3p"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/e/e0/Side_week3kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
 +
                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week4p"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/3/31/Side_week4kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
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                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week5p"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/e/e7/Side_week5kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
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                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week6p"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/e/e8/Side_week6kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
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                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week1"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/1/1b/Side_week1kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
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                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week2"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/9/94/Side_week2kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
 +
                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week3"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/e/e0/Side_week3kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
 +
                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week4"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/3/31/Side_week4kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
 +
                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week5"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/e/e7/Side_week5kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
 +
                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week6"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/e/e8/Side_week6kit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
 +
                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-week7"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/b/b2/Side_weekkit7.jpg" width="150" height="30"></a></li>
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            </ul>
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        </li>
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        <li>
 +
            <div class="category"><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-Protocol"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/e/ee/Side_protocolkit.jpg" width="150" height="30"></a></div>
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        </li>
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 +
            <div class="category"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/6/61/Side_meetingkit.jpg" width="150" height="30"></div>
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                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-Meeting-may"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/5/5d/Side_maykit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
 +
                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-Meeting-june"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/9/92/Side_junekit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
 +
                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-Meeting-july"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/f/f2/Side_julykit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
 +
                <li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-Meeting-august"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/f/fa/Side_augkit.jpg" width="150" height="30"></a></li><li><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-Meeting-september"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/8/8b/Side_sepkit.jpg" width="150" height="30"></a></li>
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            </ul>
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        </li>
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        <li>
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            <div class="category"><a href="https://2012.igem.org/Team:KIT-Kyoto/Notebook-Design"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/8/8f/Side_designnotekit.jpg" width="150" height="30"></a></div>
 +
        </li>
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    </ul>
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 +
<br>
 +
</td>
 +
 +
<td width="800px" height="510px" valign="top">
 +
<div id="MIGI">
 +
<h2>August 31st</h2>
 +
<br>
 +
 +
<Table Border Cellspacing="0">
 +
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 +
<Tr><Td>　DNA template　</Td><Td>　0.5uL　</Td></Tr>
 +
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 +
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 +
<Tr><Td>　25mM MgSO4　</Td><Td>　3.2uL　</Td></Tr>
 +
<td>　10P 5’ primer　</td><td>　3uL　</td></tr>
 +
<Tr><td>　10P 3’ primer　</td><td>　3uL　</td></tr>
 +
<Tr><td>　KOD plus　</td><td>　2uL　</td></tr>
 +
<Tr><td>　dH<sub>2</sub>O　</td><td>　68.3uL　</td></tr>
 +
<Tr><td>　Total　</td><td>　100uL　</td></tr>
 +
</Table>
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<br><BR>
 +
 +
<Table Border Cellspacing="0">
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 +
<tr><td>　　95℃　</td><td>　2min　</td><Td></Td></tr>
 +
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 +
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 +
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 +
<tr><td>　　68℃　</td><td>　30sec　</td><Td></Td></tr>
 +
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 +
</Table>
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<br><BR>
 +
 +
<h2>September 1st</h2>
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<br>
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/b/b0/0901akit.png" width="500" height="300">
 +
<br><br>
 +
<Table Border Cellspacing="0">
 +
<Tr><Td></Td><Td>　All samples　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　DNA template　</td><td>　0.3uL　</td></tr>
 +
<Tr><Td>　10× KOD plus buffer　</Td><Td>　10uL　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　2mM dNTPs　</td><td>　10uL　</td></tr><tr>
 +
<td>　25mM MgSO4　</td><td>　3.2uL　</td></tr>
 +
<td>　10P 5’ primer　</td><td>　3uL　</td></tr>
 +
<td>　10P 3’ primer　</td><td>　3uL　</td></tr>
 +
<td>　KOD plus　</td><td>　2uL　</td></tr>
 +
<td>　dH<sub>2</sub>O　</td><td>　68.5uL　</td></tr>
 +
<td>　Total　<td>　100uL　</td></tr>
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</Table>
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<br><BR>
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<Table Border Cellspacing="0">
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<Tr><Td>　Temperature　</Td><Td>　Time　</Td><Td>　Circle　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　　95℃　</td><td>　2min　</td><Td></Td></tr>
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<Tr><Td>　　95℃　</Td><Td>　15sec　</Td><Td>　25 cycle　</Td></Tr>
 +
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 +
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<td>　　14℃　</td><td>　∞　</td><Td></Td></tr>
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</Table>
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<br><br>
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<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/6/67/0901bkit.png" width="500" height="300">
 +
<br><br>
 +
 +
 +
<h2>September 3rd</h2>
 +
<BR>
 +
 +
<Table Border Cellspacing="0">
 +
<Tr><Td></Td><Td>　All samples　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　DNA template　</td><td>　0.2uL　</td></tr>
 +
<Tr><Td>　10× KOD plus buffer　</Td><Td>　5uL　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　2mM dNTPs　</td><td>　5uL　</td></tr><tr>
 +
<td>　25mM MgSO4　</td><td>　1.6uL　</td></tr><tr>
 +
<td>　10P 5’ primer　</td><td>　1.5uL　</td></tr><tr>
 +
<td>　10P 3’ primer　</td><td>　1.5uL　</td></tr><tr>
 +
<td>　KOD plus　</td><td>　1u　L</td></tr><tr>
 +
<td>　dH<sub>2</sub>O　</td><td>　34.2uL　</td></tr><tr>
 +
<td>　Total　<td>　50uL　</td></tr>
 +
</Table>
 +
<br><BR>
 +
<Table Border Cellspacing="0">
 +
<Tr><Td>　Temperature　</Td><Td>　Time　</Td><Td>　Circle　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　95℃　</td><td>　2min　</td><Td></Td></tr>
 +
<Tr><Td>　95℃　</Td><Td>　15sec　</Td><Td>　25 cycle　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　55℃(GAL4) and 58℃(Except for GAL4)　</td><td>　30sec　</td><Td>　25 cycle　</Td></tr><tr>
 +
<td>　68℃　</td><td>　2min30sec　</td><Td>　25 cycle　</Td></tr>
 +
<td>　68℃　</td><td>　2min30sec　</td><Td></Td></tr>
 +
<td>　14℃　</td><td>　∞　</td><Td></Td></tr>
 +
</Table>
 +
<br><br>
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/c/ca/0903kit.png" width="500" height="300">
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<br><br>
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 +
<h2>September 4th</h2>
 +
<br>
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<Table Border Cellspacing="0">
 +
<Tr><Td>　9/3 GAL4　</Td><Td>　40uL　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　M buffer(TOYOBO)　</td><td>　5uL　</td></tr>
 +
<Tr><Td>　XbaⅠ(TOYOBO)　</Td><Td>　0.5uL　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　SpeⅠ(TOYOBO)　</td><td>　0.5uL　</td></tr><tr>
 +
<td>　dH<sub>2</sub>O　</td><td>　4uL　</td></tr><tr>
 +
<td>　Total　</td><td>　50uL　</td></tr>
 +
</Table>
 +
<br><BR>
 +
<Table Border Cellspacing="0">
 +
<Tr><Td>　each DNA　</Td><Td>　40uL　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　3 buffer(NEB)　</td><td>　5uL　</td></tr>
 +
<Tr><Td>　BglⅡ(NEB)　</Td><Td>　0.5uL　</Td></Tr><tr>
 +
<td>　dH<sub>2</sub>O　</td><td>　4.5uL　</td></tr><tr>
 +
<td>　Total　</td><td>　50uL　</td></tr>
 +
</Table>
 +
<br><BR>
 +
 +
<Table Border Cellspacing="0">
 +
<Tr><Td>　9/3 GAL4　</Td><Td>　23uL　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　M buffer(TOYOBO)　</td><td>　10uL　</td></tr>
 +
<Tr><Td>　XbaⅠ(TOYOBO)　</Td><Td>　1uL　</Td></Tr>
 +
<Tr><Td>　SpeⅠ(TOYOBO)　</Td><Td>　1uL　</Td></Tr>
 +
<Tr><Td>　CIP　</Td><Td>　0.5uL　</Td></Tr>
 +
<td>　dH<sub>2</sub>O　</td><td>　64.5uL　</td></tr>
 +
<td>　Total　</td><td>　100uL　</td></tr>
 +
</Table>
 +
<br><BR>
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 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/b/b0/0904kit.png" width="500" height="300">
 +
<br><br>
 +
 +
<h2>September 5th</h2>
 +
<br>
 +
<Table Border Cellspacing="0">
 +
<Tr><Td></Td><td>　EGFP　</td><Td>　pSB1C3　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　DNA template　</td><td>　40uL　</td><Td>　23uL　</Td></tr>
 +
<Tr><Td>　3 buffer　</Td><Td>　5uL　</Td><Td>　5uL　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　BglⅡ　</td><td>　0.5uL　</td><Td>　0.5uL　</Td></tr><tr>
 +
<td>　dH<sub>2</sub>O　</td><td>　4.5uL　</td><Td>　21.5uL　</Td></tr>
 +
<td>　Total　</td><td>　50uL　</td><Td>　50uL　</Td></tr>
 +
</Table>
 +
<br><BR>
 +
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/3/3a/0905akit.png" width="500" height="300">
 +
<br><br>
 +
<Table Border Cellspacing="0">
 +
<Tr><Td>　DNA template　</Td><Td>　40uL　</Td></Tr>
 +
<tr><td>　4 buffer(NEB)　</td><td>　5uL　</td></tr>
 +
<Tr><Td>　SpeⅠ　</Td><Td>　0.5uL　</Td></Tr>
 +
<Tr><Td>　100×BSA </Td><Td>　0.5uL　</Td></Tr>
 +
<Tr><Td>　CIP　</Td><Td>　0.5uL　</Td></Tr>
 +
<td>　dH<sub>2</sub>O　</td><td>　4uL　</td></tr>
 +
<td>　Total　</td><td>　50uL　</td></tr>
 +
</Table>
 +
<br><BR>
 +
 +
<Table Border Cellspacing="0">
 +
<Tr><Td></Td><Td>　1uL　</Td></Tr>
 +
<tr><td></td><td>　1uL　</td></tr>
 +
<Tr><Td>　dH<sub>2</sub>O　</Td><Td>　3uL　</Td></Tr>
 +
<Tr><Td>　Ligation high　</Td><Td>　2.5uL　</Td></Tr>
 +
<td>　Total　</td><td>　7.5uL　</td></tr>
 +
</Table>
 +
<br><BR>
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/6/63/0905bkit.png" width="500" height="300">
 +
<br><br>
 +
 +
 +
 +
 +
</div>
 +
</div>
 +
</table>
 +
</td></tr>
 +
 +
</table>
 +
</body>
 +
 +
 +
</html>
</html>

Revision as of 10:02, 25 September 2012

August 31st


　All samples　
　DNA template　　0.5uL　
　10× KOD plus buffer　　10uL　
　2mM dNTPs　　10uL　
　25mM MgSO4　　3.2uL　
　10P 5’ primer　　3uL　
　10P 3’ primer　　3uL　
　KOD plus　　2uL　
　dH2O　　68.3uL　
　Total　　100uL　


　Temperature　Time　Cycle
　　95℃　　2min　
　　95℃　　15sec　　25 cycle　
　　58℃　　30sec　　25 cycle　
　　68℃　　30sec　　25 cycle　
　　68℃　　30sec　
　　14℃　　∞　


September 1st




　All samples　
　DNA template　　0.3uL　
　10× KOD plus buffer　　10uL　
　2mM dNTPs　　10uL　
　25mM MgSO4　　3.2uL　
　10P 5’ primer　　3uL　
　10P 3’ primer　　3uL　
　KOD plus　　2uL　
　dH2O　　68.5uL　
　Total　　100uL　


　Temperature　　Time　　Circle　
　　95℃　　2min　
　　95℃　　15sec　　25 cycle　
　　59℃　　30sec　　25 cycle　
　　68℃　　1min30sec(Act5c and LacZ) or 2min(GAL4 and U-T)　　25 cycle　
　　68℃　　1min30sec(Act5c and LacZ) or 2min(GAL4 and U-T)　
　　14℃　　∞　




September 3rd


　All samples　
　DNA template　　0.2uL　
　10× KOD plus buffer　　5uL　
　2mM dNTPs　　5uL　
　25mM MgSO4　　1.6uL　
　10P 5’ primer　　1.5uL　
　10P 3’ primer　　1.5uL　
　KOD plus　　1u　L
　dH2O　　34.2uL　
　Total　　50uL　


　Temperature　　Time　　Circle　
　95℃　　2min　
　95℃　　15sec　　25 cycle　
　55℃(GAL4) and 58℃(Except for GAL4)　　30sec　　25 cycle　
　68℃　　2min30sec　　25 cycle　
　68℃　　2min30sec　
　14℃　　∞　




September 4th


　9/3 GAL4　　40uL　
　M buffer(TOYOBO)　　5uL　
　XbaⅠ(TOYOBO)　　0.5uL　
　SpeⅠ(TOYOBO)　　0.5uL　
　dH2O　　4uL　
　Total　　50uL　


　each DNA　　40uL　
　3 buffer(NEB)　　5uL　
　BglⅡ(NEB)　　0.5uL　
　dH2O　　4.5uL　
　Total　　50uL　


　9/3 GAL4　　23uL　
　M buffer(TOYOBO)　　10uL　
　XbaⅠ(TOYOBO)　　1uL　
　SpeⅠ(TOYOBO)　　1uL　
　CIP　　0.5uL　
　dH2O　　64.5uL　
　Total　　100uL　




September 5th


　EGFP　　pSB1C3　
　DNA template　　40uL　　23uL　
　3 buffer　　5uL　　5uL　
　BglⅡ　　0.5uL　　0.5uL　
　dH2O　　4.5uL　　21.5uL　
　Total　　50uL　　50uL　




　DNA template　　40uL　
　4 buffer(NEB)　　5uL　
　SpeⅠ　　0.5uL　
　100×BSA 　0.5uL　
　CIP　　0.5uL　
　dH2O　　4uL　
　Total　　50uL　


　1uL　
　1uL　
　dH2O　　3uL　
　Ligation high　　2.5uL　
　Total　　7.5uL　




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