Team:SDU-Denmark/geneseq

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  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>
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-
 
-
AGGAGGTGTCACCATGCAAACCCCTGAACCCTTTACAGACCTTGAACATGAACCCCACAC
 
-
ACCCCTACTGGACCACCACCACAACCCACCACCACAAACCACCACAAAACCTTTGTTCAC
 
-
CAGGGTTGTGTCCGGTGTCACCTTTGTTTTATTCTTCTTTGGTTTCGCTATCGTATTCAT
 
<h2>Our plant genes:</h2>
<h2>Our plant genes:</h2>
<p>
<p>
First primer    Extended    Start codon    Stop codon    Restriction site        Mutagenesis primer
First primer    Extended    Start codon    Stop codon    Restriction site        Mutagenesis primer
-
1-FFT:
+
<b>1-FFT:</b>
-
AGGAGGTGTCACCATGCAAACCCCTGAACCCTTTACAGACCTTGAACATGAACCCCACACACCCCTACTGGACCACCACCACAACCCACCACCACAAACCACCACAAAACCTTTGTTCACCAGGGTTGTGTCCGGTGTCACCTTTGTTTTATTCTTCTTTGGTTTCGCTATCGTATTCATTGTTCTCAACCAACAGAACTCTTCTGTTCGTATCGTCACCAATTCGGAGAAATCTTTTATAAGGTATTCGCAGACCGATCGCTTGTCGTGGGAACGGACCGCTTTTCATTTTCAGCCTGCCAAGAATTTTATTTACGATCCAGATGGTCAGTTGTTTCACATGGGCTGGTACCATATGTTCTATCAATACAACCCATACGCACCGGTTTGGGGCAATATGTCATGGGGTCACTCAGTGTCCAAAGACATGATCAACTGGTACGAGCTGCCAGTCGCTATGGTCCCGACCGAATGGTATGATATCGAGGGCGTCTTATCCGGGTCTACCACGGTCCTTCCAAACGGTCAGATCTTTGCATTGTATACTGGGAACGCTAATGATTTTTCCCAATTACAATGCAAAGCTGTACCCGTAAACTTATCTGACCCGCTTCTTATTGAGTGGGTCAAGTATGAGGATAACCCAATCCTGTACACTCCACCAGGGATTGGGTTAAAGGACTATCGGGACCCGTCAACAGTCTGGACAGGTCCCGATGGAAAGCATAGGATGATCATGGGAACTAAACGTGGCAATACAGGCATGGTACTTGTTTACTATACCACTGATTACACGAACTACGAGTTGTTGGATGAGCCGTTGCACTCTGTTCCCAACACCGATATGTGGGAATGCGTCGACTTTTACCCGGTTTCGTTAACCAATGATAGTGCACTTGATATGGCGGCCTATGGGTCGGGTATCAAACACGTTATTAAAGAAAGTTGGGAGGGACATGGAATGGATTGGTATTCAATCGGGACATATGACGCGATAAATGATAAATGGACTCCCGATAACCCGGAACTAGATGTCGGTATCGGGTTACGGTGCGATTACGGGAGGTTTTTTGCATCAAAGAGTCTTTATGACCCATTGAAGAAAAGGAGGATCACTTGGGGTTATGTTGGAGAATCAGATAGTGCTGATCAGGACCTCTCAAGAGGATGGGCTACTGTTTATAATGTTGGAAGAACAATTGTACTAGATAGAAAGACCGGGACCCATTTACTTCATTGGCCCGTTGAGGAAGTCGAGAGTTTGAGATACAACGGTCAGGAGTTTAAAGAGATCAAGCTAGAGCCCGGTTCAATCATTCCACTCGACATAGGCACGGCTACACAGTTGGACATAGTTGCAACATTTGAGGTGGATCAAGCAGCGTTGAACGCGACAAGTGAAACCGATGATATTTATGGTTGCACCACTAGCTTAGGTGCAGCCCAAAGGGGAAGTTTGGGACCATTTGGTCTTGCGGTTCTAGCCGATGGAACCCTTTCTGAGTTAACTCCGGTTTATTTCTATATAGCTAAAAAGGCAGATGGAGGTGTGTCGACACATTTTTGTACCGATAAGCTAAGGTCATCACTAGATTATGATGGGGAGAGAGTGGTGTATGGGGGCACTGTTCCTGTGTTAGATGATGAAGAACTCACAATGAGGCTATTGGTGGATCATTCGATAGTGGAGGGGTTTGCGCAAGGAGGAAGGACGGTTATAACATCAAGGGCGTATCCAACAAAAGCGATATACGAACAAGCGAAGCTGTTCTTGTTCAACAACGCCACAGGTACGAGTGTGAAAGCATCTCTCAAGATTTGGCAAATGGCTTCTGCACCAATTCATCAATACCCTTTTTAATTACCGGCTATCGCTATCCTTTTTGTTATTG
+
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
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 +
CATCAATACCCTTTTTAATTACCGGCTATCGCTATCCTTTTTGTTATTG</br>

Revision as of 14:52, 26 September 2012

iGEM TEAM ::: SDU-DENMARK courtesy of NIAID



Standard restriction sites:


EcoRI:          5' GAATTC
                      3' CTTAAG

XbaI:            5' T*CTAGA
                      3' AGATC*T

SpeI:             5' A*CTAGT
                      3' TGATC*A

PstI:              5' CTGCAG
                      3' GACGTC

Our plant genes:

First primer Extended Start codon Stop codon Restriction site Mutagenesis primer 1-FFT: AGGAGGTGTCACCATGCAAACCCCTGAACCCTTTACAGACCTTGAACATGAACCCCACACACCCCTACTGGACCACCACCACAACCCACCACCACAA
ACCACCACAAAACCTTTGTTCACCAGGGTTGTGTCCGGTGTCACCTTTGTTTTATTCTTCTTTGGTTTCGCTATCGTATTCATTGTTCTCAACCAAC
AGAACTCTTCTGTTCGTATCGTCACCAATTCGGAGAAATCTTTTATAAGGTATTCGCAGACCGATCGCTTGTCGTGGGAACGGACCGCTTTTCATTT
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TGGGGCAATATGTCATGGGGTCACTCAGTGTCCAAAGACATGATCAACTGGTACGAGCTGCCAGTCGCTATGGTCCCGACCGAATGGTATGATATCG
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TTTTTGCATCAAAGAGTCTTTATGACCCATTGAAGAAAAGGAGGATCACTTGGGGTTATGTTGGAGAATCAGATAGTGCTGATCAGGACCTCTCAAG
AGGATGGGCTACTGTTTATAATGTTGGAAGAACAATTGTACTAGATAGAAAGACCGGGACCCATTTACTTCATTGGCCCGTTGAGGAAGTCGAGAGT
TTGAGATACAACGGTCAGGAGTTTAAAGAGATCAAGCTAGAGCCCGGTTCAATCATTCCACTCGACATAGGCACGGCTACACAGTTGGACATAGTTG
CAACATTTGAGGTGGATCAAGCAGCGTTGAACGCGACAAGTGAAACCGATGATATTTATGGTTGCACCACTAGCTTAGGTGCAGCCCAAAGGGGAAG
TTTGGGACCATTTGGTCTTGCGGTTCTAGCCGATGGAACCCTTTCTGAGTTAACTCCGGTTTATTTCTATATAGCTAAAAAGGCAGATGGAGGTGTG
TCGACACATTTTTGTACCGATAAGCTAAGGTCATCACTAGATTATGATGGGGAGAGAGTGGTGTATGGGGGCACTGTTCCTGTGTTAGATGATGAAG
AACTCACAATGAGGCTATTGGTGGATCATTCGATAGTGGAGGGGTTTGCGCAAGGAGGAAGGACGGTTATAACATCAAGGGCGTATCCAACAAAAGC
GATATACGAACAAGCGAAGCTGTTCTTGTTCAACAACGCCACAGGTACGAGTGTGAAAGCATCTCTCAAGATTTGGCAAATGGCTTCTGCACCAATT
CATCAATACCCTTTTTAATTACCGGCTATCGCTATCCTTTTTGTTATTG