Team:SDU-Denmark/geneseq

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<h2>Standard restriction sites:</h2>
<h2>Standard restriction sites:</h2>
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EcoRI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;      5' GAATTC </br>
EcoRI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;      5' GAATTC </br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;            3' CTTAAG </br></br>
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       &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' AGATC*T </br></br>
       &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' AGATC*T </br></br>
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SpeI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;    5' A*CTAGT </br>
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SpeI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;    5' A*CTAGT </br>
   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3' TGATC*A </br></br>
   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3' TGATC*A </br></br>
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PstI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' CTGCAG  </br>
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PstI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' CTGCAG  </br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>

Revision as of 14:41, 26 September 2012

iGEM TEAM ::: SDU-DENMARK courtesy of NIAID

Standard restriction sites:


EcoRI:          5' GAATTC
                      3' CTTAAG

XbaI:            5' T*CTAGA
                      3' AGATC*T

SpeI:              5' A*CTAGT
                      3' TGATC*A

PstI:              5' CTGCAG
                      3' GACGTC

Our plant genes:

First primer Extended Start codon Stop codon Restriction site Mutagenesis primer 1-FFT: AGGAGGTGTCACCATGCAAACCCCTGAACCCTTTACAGACCTTGAACATGAACCCCACACACCCCTACTGGACCACCACCACAACCCACCACCACAAACCACCACAAAACCTTTGTTCACCAGGGTTGTGTCCGGTGTCACCTTTGTTTTATTCTTCTTTGGTTTCGCTATCGTATTCATTGTTCTCAACCAACAGAACTCTTCTGTTCGTATCGTCACCAATTCGGAGAAATCTTTTATAAGGTATTCGCAGACCGATCGCTTGTCGTGGGAACGGACCGCTTTTCATTTTCAGCCTGCCAAGAATTTTATTTACGATCCAGATGGTCAGTTGTTTCACATGGGCTGGTACCATATGTTCTATCAATACAACCCATACGCACCGGTTTGGGGCAATATGTCATGGGGTCACTCAGTGTCCAAAGACATGATCAACTGGTACGAGCTGCCAGTCGCTATGGTCCCGACCGAATGGTATGATATCGAGGGCGTCTTATCCGGGTCTACCACGGTCCTTCCAAACGGTCAGATCTTTGCATTGTATACTGGGAACGCTAATGATTTTTCCCAATTACAATGCAAAGCTGTACCCGTAAACTTATCTGACCCGCTTCTTATTGAGTGGGTCAAGTATGAGGATAACCCAATCCTGTACACTCCACCAGGGATTGGGTTAAAGGACTATCGGGACCCGTCAACAGTCTGGACAGGTCCCGATGGAAAGCATAGGATGATCATGGGAACTAAACGTGGCAATACAGGCATGGTACTTGTTTACTATACCACTGATTACACGAACTACGAGTTGTTGGATGAGCCGTTGCACTCTGTTCCCAACACCGATATGTGGGAATGCGTCGACTTTTACCCGGTTTCGTTAACCAATGATAGTGCACTTGATATGGCGGCCTATGGGTCGGGTATCAAACACGTTATTAAAGAAAGTTGGGAGGGACATGGAATGGATTGGTATTCAATCGGGACATATGACGCGATAAATGATAAATGGACTCCCGATAACCCGGAACTAGATGTCGGTATCGGGTTACGGTGCGATTACGGGAGGTTTTTTGCATCAAAGAGTCTTTATGACCCATTGAAGAAAAGGAGGATCACTTGGGGTTATGTTGGAGAATCAGATAGTGCTGATCAGGACCTCTCAAGAGGATGGGCTACTGTTTATAATGTTGGAAGAACAATTGTACTAGATAGAAAGACCGGGACCCATTTACTTCATTGGCCCGTTGAGGAAGTCGAGAGTTTGAGATACAACGGTCAGGAGTTTAAAGAGATCAAGCTAGAGCCCGGTTCAATCATTCCACTCGACATAGGCACGGCTACACAGTTGGACATAGTTGCAACATTTGAGGTGGATCAAGCAGCGTTGAACGCGACAAGTGAAACCGATGATATTTATGGTTGCACCACTAGCTTAGGTGCAGCCCAAAGGGGAAGTTTGGGACCATTTGGTCTTGCGGTTCTAGCCGATGGAACCCTTTCTGAGTTAACTCCGGTTTATTTCTATATAGCTAAAAAGGCAGATGGAGGTGTGTCGACACATTTTTGTACCGATAAGCTAAGGTCATCACTAGATTATGATGGGGAGAGAGTGGTGTATGGGGGCACTGTTCCTGTGTTAGATGATGAAGAACTCACAATGAGGCTATTGGTGGATCATTCGATAGTGGAGGGGTTTGCGCAAGGAGGAAGGACGGTTATAACATCAAGGGCGTATCCAACAAAAGCGATATACGAACAAGCGAAGCTGTTCTTGTTCAACAACGCCACAGGTACGAGTGTGAAAGCATCTCTCAAGATTTGGCAAATGGCTTCTGCACCAATTCATCAATACCCTTTTTAATTACCGGCTATCGCTATCCTTTTTGTTATTG

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