Team:SDU-Denmark/geneseq

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XbaI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' T*CTAGA </br>
XbaI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' T*CTAGA </br>
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       &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;      3' AGATC*T </br></br>
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       &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;      3' AGATC*T </br></br>
SpeI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;    5' A*CTAGT </br>
SpeI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;    5' A*CTAGT </br>
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   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3' TGATC*A </br></br>
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   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3' TGATC*A </br></br>
PstI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' CTGCAG  </br>
PstI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' CTGCAG  </br>
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  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>
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  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>

Revision as of 14:38, 26 September 2012

iGEM TEAM ::: SDU-DENMARK courtesy of NIAID

Standard restriction sites:

EcoRI:          5' GAATTC
                      3' CTTAAG

XbaI:          5' T*CTAGA
                      3' AGATC*T

SpeI:          5' A*CTAGT
                      3' TGATC*A

PstI:      5' CTGCAG
                      3' GACGTC

Our plant genes:

First primer Extended Start codon Stop codon Restriction site Mutagenesis primer 1-FFT: AGGAGGTGTCACCATGCAAACCCCTGAACCCTTTACAGACCTTGAACATGAACCCCACACACCCCTACTGGACCACCACCACAACCCACCACCACAAACCACCACAAAACCTTTGTTCACCAGGGTTGTGTCCGGTGTCACCTTTGTTTTATTCTTCTTTGGTTTCGCTATCGTATTCATTGTTCTCAACCAACAGAACTCTTCTGTTCGTATCGTCACCAATTCGGAGAAATCTTTTATAAGGTATTCGCAGACCGATCGCTTGTCGTGGGAACGGACCGCTTTTCATTTTCAGCCTGCCAAGAATTTTATTTACGATCCAGATGGTCAGTTGTTTCACATGGGCTGGTACCATATGTTCTATCAATACAACCCATACGCACCGGTTTGGGGCAATATGTCATGGGGTCACTCAGTGTCCAAAGACATGATCAACTGGTACGAGCTGCCAGTCGCTATGGTCCCGACCGAATGGTATGATATCGAGGGCGTCTTATCCGGGTCTACCACGGTCCTTCCAAACGGTCAGATCTTTGCATTGTATACTGGGAACGCTAATGATTTTTCCCAATTACAATGCAAAGCTGTACCCGTAAACTTATCTGACCCGCTTCTTATTGAGTGGGTCAAGTATGAGGATAACCCAATCCTGTACACTCCACCAGGGATTGGGTTAAAGGACTATCGGGACCCGTCAACAGTCTGGACAGGTCCCGATGGAAAGCATAGGATGATCATGGGAACTAAACGTGGCAATACAGGCATGGTACTTGTTTACTATACCACTGATTACACGAACTACGAGTTGTTGGATGAGCCGTTGCACTCTGTTCCCAACACCGATATGTGGGAATGCGTCGACTTTTACCCGGTTTCGTTAACCAATGATAGTGCACTTGATATGGCGGCCTATGGGTCGGGTATCAAACACGTTATTAAAGAAAGTTGGGAGGGACATGGAATGGATTGGTATTCAATCGGGACATATGACGCGATAAATGATAAATGGACTCCCGATAACCCGGAACTAGATGTCGGTATCGGGTTACGGTGCGATTACGGGAGGTTTTTTGCATCAAAGAGTCTTTATGACCCATTGAAGAAAAGGAGGATCACTTGGGGTTATGTTGGAGAATCAGATAGTGCTGATCAGGACCTCTCAAGAGGATGGGCTACTGTTTATAATGTTGGAAGAACAATTGTACTAGATAGAAAGACCGGGACCCATTTACTTCATTGGCCCGTTGAGGAAGTCGAGAGTTTGAGATACAACGGTCAGGAGTTTAAAGAGATCAAGCTAGAGCCCGGTTCAATCATTCCACTCGACATAGGCACGGCTACACAGTTGGACATAGTTGCAACATTTGAGGTGGATCAAGCAGCGTTGAACGCGACAAGTGAAACCGATGATATTTATGGTTGCACCACTAGCTTAGGTGCAGCCCAAAGGGGAAGTTTGGGACCATTTGGTCTTGCGGTTCTAGCCGATGGAACCCTTTCTGAGTTAACTCCGGTTTATTTCTATATAGCTAAAAAGGCAGATGGAGGTGTGTCGACACATTTTTGTACCGATAAGCTAAGGTCATCACTAGATTATGATGGGGAGAGAGTGGTGTATGGGGGCACTGTTCCTGTGTTAGATGATGAAGAACTCACAATGAGGCTATTGGTGGATCATTCGATAGTGGAGGGGTTTGCGCAAGGAGGAAGGACGGTTATAACATCAAGGGCGTATCCAACAAAAGCGATATACGAACAAGCGAAGCTGTTCTTGTTCAACAACGCCACAGGTACGAGTGTGAAAGCATCTCTCAAGATTTGGCAAATGGCTTCTGCACCAATTCATCAATACCCTTTTTAATTACCGGCTATCGCTATCCTTTTTGTTATTG

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