Team:SDU-Denmark/geneseq

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<h2>Standard restriction sites:</h2>
<h2>Standard restriction sites:</h2>
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EcoRI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;      5' GAATTC </br>
EcoRI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;      5' GAATTC </br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;            3' CTTAAG </br></br>
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XbaI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' T*CTAGA </br>
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XbaI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' T*CTAGA </br>
       &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' AGATC*T </br></br>
       &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' AGATC*T </br></br>
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SpeI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;   5' A*CTAGT </br>
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SpeI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;    5' A*CTAGT </br>
   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3' TGATC*A </br></br>
   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3' TGATC*A </br></br>
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PstI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5' CTGCAG  </br>
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PstI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' CTGCAG  </br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>
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<h2>Our plant genes:</h2>
<h2>Our plant genes:</h2>
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First primer    Extended    Start codon    Stop codon    Restriction site        Mutagenesis primer
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1-FFT:
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AGGAGGTGTCACCATGCAAACCCCTGAACCCTTTACAGACCTTGAACATGAACCCCACACACCCCTACTGGACCACCACCACAACCCACCACCACAAACCACCACAAAACCTTTGTTCACCAGGGTTGTGTCCGGTGTCACCTTTGTTTTATTCTTCTTTGGTTTCGCTATCGTATTCATTGTTCTCAACCAACAGAACTCTTCTGTTCGTATCGTCACCAATTCGGAGAAATCTTTTATAAGGTATTCGCAGACCGATCGCTTGTCGTGGGAACGGACCGCTTTTCATTTTCAGCCTGCCAAGAATTTTATTTACGATCCAGATGGTCAGTTGTTTCACATGGGCTGGTACCATATGTTCTATCAATACAACCCATACGCACCGGTTTGGGGCAATATGTCATGGGGTCACTCAGTGTCCAAAGACATGATCAACTGGTACGAGCTGCCAGTCGCTATGGTCCCGACCGAATGGTATGATATCGAGGGCGTCTTATCCGGGTCTACCACGGTCCTTCCAAACGGTCAGATCTTTGCATTGTATACTGGGAACGCTAATGATTTTTCCCAATTACAATGCAAAGCTGTACCCGTAAACTTATCTGACCCGCTTCTTATTGAGTGGGTCAAGTATGAGGATAACCCAATCCTGTACACTCCACCAGGGATTGGGTTAAAGGACTATCGGGACCCGTCAACAGTCTGGACAGGTCCCGATGGAAAGCATAGGATGATCATGGGAACTAAACGTGGCAATACAGGCATGGTACTTGTTTACTATACCACTGATTACACGAACTACGAGTTGTTGGATGAGCCGTTGCACTCTGTTCCCAACACCGATATGTGGGAATGCGTCGACTTTTACCCGGTTTCGTTAACCAATGATAGTGCACTTGATATGGCGGCCTATGGGTCGGGTATCAAACACGTTATTAAAGAAAGTTGGGAGGGACATGGAATGGATTGGTATTCAATCGGGACATATGACGCGATAAATGATAAATGGACTCCCGATAACCCGGAACTAGATGTCGGTATCGGGTTACGGTGCGATTACGGGAGGTTTTTTGCATCAAAGAGTCTTTATGACCCATTGAAGAAAAGGAGGATCACTTGGGGTTATGTTGGAGAATCAGATAGTGCTGATCAGGACCTCTCAAGAGGATGGGCTACTGTTTATAATGTTGGAAGAACAATTGTACTAGATAGAAAGACCGGGACCCATTTACTTCATTGGCCCGTTGAGGAAGTCGAGAGTTTGAGATACAACGGTCAGGAGTTTAAAGAGATCAAGCTAGAGCCCGGTTCAATCATTCCACTCGACATAGGCACGGCTACACAGTTGGACATAGTTGCAACATTTGAGGTGGATCAAGCAGCGTTGAACGCGACAAGTGAAACCGATGATATTTATGGTTGCACCACTAGCTTAGGTGCAGCCCAAAGGGGAAGTTTGGGACCATTTGGTCTTGCGGTTCTAGCCGATGGAACCCTTTCTGAGTTAACTCCGGTTTATTTCTATATAGCTAAAAAGGCAGATGGAGGTGTGTCGACACATTTTTGTACCGATAAGCTAAGGTCATCACTAGATTATGATGGGGAGAGAGTGGTGTATGGGGGCACTGTTCCTGTGTTAGATGATGAAGAACTCACAATGAGGCTATTGGTGGATCATTCGATAGTGGAGGGGTTTGCGCAAGGAGGAAGGACGGTTATAACATCAAGGGCGTATCCAACAAAAGCGATATACGAACAAGCGAAGCTGTTCTTGTTCAACAACGCCACAGGTACGAGTGTGAAAGCATCTCTCAAGATTTGGCAAATGGCTTCTGCACCAATTCATCAATACCCTTTTTAATTACCGGCTATCGCTATCCTTTTTGTTATTG
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<b>1-SST:</b>
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<b>1-FFT:</b>
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Latest revision as of 14:58, 26 September 2012

iGEM TEAM ::: SDU-DENMARK courtesy of NIAID



Standard restriction sites:


EcoRI:          5' GAATTC
                      3' CTTAAG

XbaI:            5' T*CTAGA
                      3' AGATC*T

SpeI:             5' A*CTAGT
                      3' TGATC*A

PstI:              5' CTGCAG
                      3' GACGTC

Our plant genes:

1-SST: 1-FFT: