Team:UT-Tokyo/Project/H2 E.coli/Discussion

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</p><img id="abstimg" src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/d/d3/UT-Tokyo_blank01.png" alt="box-background image" /><p>
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<img id="abstimg" src="https://static.igem.org/mediawiki/2012/1/15/UT-Tokyo_discussion1.jpg" style="opacity:0.6" alt="box-background image" />
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<!-- ここから</p>の前までを編集してください -->
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このページの概要を、簡単に記述。
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Here we analyze the results and<br /> describe future applications.
</p></div><p></html>
</p></div><p></html>
<!-- 以下テンプレ部分まで自由記述 -->
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== 編集の仕方 ==
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== The Effects of the E363G Mutation in fhlA Gene on Hydrogen Production ==
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* ページ右上にあるログインリンクからログインできます。
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Sanchez-Torres et al. obtained by random mutagenesis several mutants of the transcriptional factor gene ''fhlA'' in which hydrogen gas production is enhanced.[[#References|[1]]] Among these mutants, the E363G mutation allowed ''E.coli'' cells to produce hydrogen six times more than the original ''fhlA'' under anaerobic conditions with 20 mM formate. Therefore, we made a BioBrick part named ''fhlA'' -E363G by introducing the same mutation into the original wild type ''fhlA'' gene which we BioBricked.
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* ログイン済みの場合は、ページ左上にカーソルを持っていけば、editから内容を編集できます。（日本語メニューの場合は「編集」）
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* 新規ページを作るには、アドレスバーに作りたいページのURLを打ち込めばできます。そのページには、このテンプレートページの内容を全てコピーして貼り付け、指定がある部分を編集して自由記述すればOKです。
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== wikiの記法 ==
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Our aim is to make ''E. coli'' cells which are capable of producing hydrogen in a glucose-rich environment.Hydrogen production was elevated in the ''fhlA'' overexpression cells compared to the wild type. In an attempt to further increase hydrogen production, we compared the hydrogen production of two ''E. coli'' strains which over-expresses wild-type ''fhlA'' and ''fhlA'' -E363G in a glucose-rich environment. As a result, the ''fhlA'' -E363G expressing strain generated less hydrogen gas than the wild type ''fhlA'' expressing strain. It is considered that under glucose-rich conditions the E363G mutation in ''fhlA'' does not lead to an increase of hydrogen production compared to wild type ''fhlA''.
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[https://2008.igem.org/Team:Chiba/Internal/foredit 2008年度Team:Chibaのwiki]が参考になります。
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== The Effects of Formate on Hydrogen Production ==
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そのページでもリンクされていますが、書き方は
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We obtained the results which indicate that formate do not have significant effect on hydrogen production. The results do not support previous study, which is not conflicting to the project.
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[http://ja.wikipedia.org/wiki/Help:%E3%83%9A%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%81%AE%E7%B7%A8%E9%9B%86 Wikipedia-Help:ページの編集]準拠のようです。
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== 見出し1 ==
 
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== 見出し2 ==
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The results show that ''fhlA'' overexpression elevate hydrogen production, but there was no correlation between production efficiency and formate addition or medium and E363G mutation, which is unexpected. In order to make system more efficient, further investigation on these factors is needed.
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=== 小見出し1 ===
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リンクの例：<br />
 
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*ページ内リンク
 
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**右のように[[#見出し1]]と書くと見出し1へのリンクが張られます。ページトップ[[#top]]と、各見出しへはこのようにしてリンクが張れます。
 
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*Wiki内部リンク
 
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**右のように[[Team:UT-Tokyo/Internal/Sandbox]] と書くとそのまま表示され<br />
 
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**右のように[[Team:UT-Tokyo/Internal/Sandbox|Sandboxへのリンク]]と書くと「Sandboxへのリンク」という文字列にリンクが張られます。
 
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*Wiki外部リンク
 
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**右のようにhttps://2012.igem.org/Team:UT-Tokyoと書くとそのまま表示され、
 
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**右のように[https://2012.igem.org/Team:UT-Tokyo UT-Tokyoのトップページ]と書くと「UT-Tokyoのトップページ」という文字列にリンクが張られます。
 
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**右のように[https://2012.igem.org/Team:UT-Tokyo]と書くと、自動で番号のついたリンクが張られます。
 
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画像にリンクしたい場合：
 
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[[media:example.jpg]]
 
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段落内改行は<br />
 
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;定義リストの定義
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:定義リストの説明
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=== References ===
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[1]Viviana Sanchez-Torres, Toshinari Maeda, and Thomas K. Wood. Protein Engineering of the Transcriptional Activator FhlA To Enhance Hydrogen Production in Escherichia coli. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 75, 5639–5646. 2009.
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<!-- 以上自由記述 -->
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{{:Team:UT-Tokyo/Template/Side|twdisp=block}}
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<!-- 以下サイドメニュー編集 ;の後には、もしこのページが第2階層にあれば、そのページ内の見出しを羅列。第1階層にあれば、そのカテゴリ内の第2階層ページ名を羅列する。;の後には名称を、:の後にはその説明を記述する。:と;のセットは適当に増減してください -->
<!-- 以下サイドメニュー編集 ;の後には、もしこのページが第2階層にあれば、そのページ内の見出しを羅列。第1階層にあれば、そのカテゴリ内の第2階層ページ名を羅列する。;の後には名称を、:の後にはその説明を記述する。:と;のセットは適当に増減してください -->
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;[[#見出し1|見出し1or子下階層ページ名1]]
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;[[#The Effects of the E363G Mutation in fhlA Gene on Hydrogen Production|The Effects of the E363G Mutation in fhlA Gene on Hydrogen Production]]
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:題名1の説明<br />改行して説明の続き
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:
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;[[#見出し2|見出し2or子階層ページ名2]]
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;[[#The Effects of Formate on Hydrogen Production|The Effects of Formate on Hydrogen Production]]
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:説明
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:
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;見出し2or子階層ページ名3
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;[[#References|References]]
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:description
+
:
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;見出し2or子階層ページ名4
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:description
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<!-- ここまでサイドメニュー編集を -->
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<html></p>
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</div><p>
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{{:Team:UT-Tokyo/Template/Footer|prevname=H2 E.coli: Results|prevfull=Project/H2_E.coli/Results|nextname=Project2: Inhibition Without Knockout|nextfull=Project/Inhibition}}

Latest revision as of 03:45, 27 September 2012

H2 E.coli: Discussion

box-background image

Here we analyze the results and
describe future applications.

The Effects of the E363G Mutation in fhlA Gene on Hydrogen Production

Sanchez-Torres et al. obtained by random mutagenesis several mutants of the transcriptional factor gene fhlA in which hydrogen gas production is enhanced.[1] Among these mutants, the E363G mutation allowed E.coli cells to produce hydrogen six times more than the original fhlA under anaerobic conditions with 20 mM formate. Therefore, we made a BioBrick part named fhlA -E363G by introducing the same mutation into the original wild type fhlA gene which we BioBricked.

Our aim is to make E. coli cells which are capable of producing hydrogen in a glucose-rich environment.Hydrogen production was elevated in the fhlA overexpression cells compared to the wild type. In an attempt to further increase hydrogen production, we compared the hydrogen production of two E. coli strains which over-expresses wild-type fhlA and fhlA -E363G in a glucose-rich environment. As a result, the fhlA -E363G expressing strain generated less hydrogen gas than the wild type fhlA expressing strain. It is considered that under glucose-rich conditions the E363G mutation in fhlA does not lead to an increase of hydrogen production compared to wild type fhlA.

The Effects of Formate on Hydrogen Production

We obtained the results which indicate that formate do not have significant effect on hydrogen production. The results do not support previous study, which is not conflicting to the project.


The results show that fhlA overexpression elevate hydrogen production, but there was no correlation between production efficiency and formate addition or medium and E363G mutation, which is unexpected. In order to make system more efficient, further investigation on these factors is needed.




References

[1]Viviana Sanchez-Torres, Toshinari Maeda, and Thomas K. Wood. Protein Engineering of the Transcriptional Activator FhlA To Enhance Hydrogen Production in Escherichia coli. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 75, 5639–5646. 2009.


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