Team:SDU-Denmark/geneseq

From 2012.igem.org

(Difference between revisions)
Line 249: Line 249:
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;            3' CTTAAG </br></br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;            3' CTTAAG </br></br>
-
XbaI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' T*CTAGA </br>
+
XbaI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' T*CTAGA </br>
       &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' AGATC*T </br></br>
       &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' AGATC*T </br></br>
-
SpeI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;   5' A*CTAGT </br>
+
SpeI: &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;    5' A*CTAGT </br>
   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3' TGATC*A </br></br>
   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3' TGATC*A </br></br>
-
PstI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5' CTGCAG  </br>
+
PstI:  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  5' CTGCAG  </br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>
  &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;  3' GACGTC </br></br>

Revision as of 14:40, 26 September 2012

iGEM TEAM ::: SDU-DENMARK courtesy of NIAID

Standard restriction sites:

EcoRI:          5' GAATTC
                      3' CTTAAG

XbaI:            5' T*CTAGA
                      3' AGATC*T

SpeI:            5' A*CTAGT
                      3' TGATC*A

PstI:            5' CTGCAG
                      3' GACGTC

Our plant genes:

First primer Extended Start codon Stop codon Restriction site Mutagenesis primer 1-FFT: AGGAGGTGTCACCATGCAAACCCCTGAACCCTTTACAGACCTTGAACATGAACCCCACACACCCCTACTGGACCACCACCACAACCCACCACCACAAACCACCACAAAACCTTTGTTCACCAGGGTTGTGTCCGGTGTCACCTTTGTTTTATTCTTCTTTGGTTTCGCTATCGTATTCATTGTTCTCAACCAACAGAACTCTTCTGTTCGTATCGTCACCAATTCGGAGAAATCTTTTATAAGGTATTCGCAGACCGATCGCTTGTCGTGGGAACGGACCGCTTTTCATTTTCAGCCTGCCAAGAATTTTATTTACGATCCAGATGGTCAGTTGTTTCACATGGGCTGGTACCATATGTTCTATCAATACAACCCATACGCACCGGTTTGGGGCAATATGTCATGGGGTCACTCAGTGTCCAAAGACATGATCAACTGGTACGAGCTGCCAGTCGCTATGGTCCCGACCGAATGGTATGATATCGAGGGCGTCTTATCCGGGTCTACCACGGTCCTTCCAAACGGTCAGATCTTTGCATTGTATACTGGGAACGCTAATGATTTTTCCCAATTACAATGCAAAGCTGTACCCGTAAACTTATCTGACCCGCTTCTTATTGAGTGGGTCAAGTATGAGGATAACCCAATCCTGTACACTCCACCAGGGATTGGGTTAAAGGACTATCGGGACCCGTCAACAGTCTGGACAGGTCCCGATGGAAAGCATAGGATGATCATGGGAACTAAACGTGGCAATACAGGCATGGTACTTGTTTACTATACCACTGATTACACGAACTACGAGTTGTTGGATGAGCCGTTGCACTCTGTTCCCAACACCGATATGTGGGAATGCGTCGACTTTTACCCGGTTTCGTTAACCAATGATAGTGCACTTGATATGGCGGCCTATGGGTCGGGTATCAAACACGTTATTAAAGAAAGTTGGGAGGGACATGGAATGGATTGGTATTCAATCGGGACATATGACGCGATAAATGATAAATGGACTCCCGATAACCCGGAACTAGATGTCGGTATCGGGTTACGGTGCGATTACGGGAGGTTTTTTGCATCAAAGAGTCTTTATGACCCATTGAAGAAAAGGAGGATCACTTGGGGTTATGTTGGAGAATCAGATAGTGCTGATCAGGACCTCTCAAGAGGATGGGCTACTGTTTATAATGTTGGAAGAACAATTGTACTAGATAGAAAGACCGGGACCCATTTACTTCATTGGCCCGTTGAGGAAGTCGAGAGTTTGAGATACAACGGTCAGGAGTTTAAAGAGATCAAGCTAGAGCCCGGTTCAATCATTCCACTCGACATAGGCACGGCTACACAGTTGGACATAGTTGCAACATTTGAGGTGGATCAAGCAGCGTTGAACGCGACAAGTGAAACCGATGATATTTATGGTTGCACCACTAGCTTAGGTGCAGCCCAAAGGGGAAGTTTGGGACCATTTGGTCTTGCGGTTCTAGCCGATGGAACCCTTTCTGAGTTAACTCCGGTTTATTTCTATATAGCTAAAAAGGCAGATGGAGGTGTGTCGACACATTTTTGTACCGATAAGCTAAGGTCATCACTAGATTATGATGGGGAGAGAGTGGTGTATGGGGGCACTGTTCCTGTGTTAGATGATGAAGAACTCACAATGAGGCTATTGGTGGATCATTCGATAGTGGAGGGGTTTGCGCAAGGAGGAAGGACGGTTATAACATCAAGGGCGTATCCAACAAAAGCGATATACGAACAAGCGAAGCTGTTCTTGTTCAACAACGCCACAGGTACGAGTGTGAAAGCATCTCTCAAGATTTGGCAAATGGCTTCTGCACCAATTCATCAATACCCTTTTTAATTACCGGCTATCGCTATCCTTTTTGTTATTG

Retrieved from "http://2012.igem.org/Team:SDU-Denmark/geneseq"